现在使用较多的生态厕所是微生物降解型生态环保厕所，此种厕所的处理技术是应用微生物菌种来处理粪便的，因微生物菌种的生长繁殖需要降解到粪便的因素，经过降解后的粪便可形成水与二氧化碳，水经过净化处理后可用作冲厕处理，剩余少量残渣可做为肥料使用。
  通过活跃的微生物菌种降解、转化、吸附粪便中的异味，降解后的粪便实现无害化，从而可以做资源化处理。控制好温度、湿度可以达到零排放的标准。使用粪无害化、资源化，对周边的环境不会造成污染。
  就是说生态厕所是可以做没污染、资源化、节能环保减排的，想要降低厕所对环境的污染就可以选择建设生态厕所。